โรคต่างๆในอุตสาหกรรมการเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำแบบเข้มข้น เต่ากระดองนิ่มของจีนมีความเสี่ยงต่อโรคแบคทีเรียหลายชนิดมากขึ้น [17]ในปี พ.ศ. 2555 เต่ากระดองนิ่มของจีนเป็นเต่าสายพันธุ์แรกที่ได้รับการระบาดของโรคจากแบคทีเรียในกระดองขนาดใหญ่ ส่งผลให้การเจริญเติบโตช้าลงและการเสียชีวิตเพิ่มขึ้น สิ่งนี้ไม่เพียงแต่ทำให้ P. sinensisลดลงเท่านั้นแต่ยังทำให้เกิดความสูญเสียทางเศรษฐกิจอย่างรุนแรงต่ออุตสาหกรรมการเพาะเลี้ยงเต่าอีกด้วย [17] แอโรโมแนส เอสพีพี. ,   ความรู้ทั่วไปเรื่องตะพาบน้ำ  Citrobacter freundiiและEdwardsiella tardaได้รับการระบุว่าเป็นแบคทีเรียที่เป็นสาเหตุที่สำคัญที่สุด [18]แบคทีเรียก่อโรคอื่นๆ ที่ระบุคือไครซีโอแบคทีเรียมเอสพีพี ประชากรในป่าถูกระบุว่ามีความเสี่ยงในบัญชีแดงของ IUCN ในทาง ตรงกันข้ามการทำฟาร์มจำนวนมากและการปล่อยP. sinensisเป็นที่รู้กันว่านำไปสู่การผสมพันธุ์ สายพันธุ์ Pelodiscus ที่มีลักษณะเฉพาะอื่นๆ อีกหลาย สายพันธุ์ ซึ่งบางสายพันธุ์อาจเป็นสายพันธุ์ที่แตกต่างกันออกไป ซึ่งในทางกลับกันก็คุกคามแหล่งรวมยีนของพวกมันด้วย