สภาพอากาศของไบคาลนั้นอบอุ่นกว่าพื้นที่โดยรอบมาก อุณหภูมิอากาศฤดูหนาวเฉลี่ย −6 °F (−21 °C) และอุณหภูมิเฉลี่ยในเดือนสิงหาคม 52 °F (11 °C) ผิวทะเลสาบกลายเป็นน้ำแข็งในเดือนมกราคมและละลายในเดือนพฤษภาคมหรือมิถุนายน อุณหภูมิของน้ำที่ผิวน้ำในเดือนสิงหาคมอยู่ระหว่าง 50 ถึง 54 °F (10 และ 12 °C) และสูงถึง 68 °F (20 °C) ในบริเวณน้ำตื้นนอกชายฝั่ง ทะเลสาบ คลื่นสามารถสูงได้ถึง 15 ฟุต (4.6 เมตร) น้ำใสมาก จากพื้นผิวสามารถมองเห็นได้ไกลถึง 130 ฟุต (40 เมตร) มีความเค็มต่ำและมีแร่ธาตุน้อย