ไรโบโซมจากแบคทีเรียอาร์เคียและยูคาริโอตในระบบสามโดเมน มี ลักษณะคล้ายคลึงกันในระดับที่น่าทึ่ง ซึ่งเป็นหลักฐานของการกำเนิดร่วมกัน ต่างกันที่ขนาด ลำดับ ไรโบโซม โครงสร้าง และอัตราส่วนของโปรตีนต่อ RNA ความแตกต่างในโครงสร้างทำให้ยาปฏิชีวนะ บางชนิด